Cụ thể, theo Quyết định xử phạt của cơ quan thuế, về thuế GTGT, Thực phẩm Hữu Nghị đã kê khai khấu trừ đối với hóa đơn hàng hóa, dịch vụ trả hộ cho chi nhánh không đúng quy định; kê khai khấu trừ các hóa đơn sau khi cơ quan thuế công bố quyết định thanh tra chưa đúng quy định; kê khai khấu trừ đối với các hóa đơn mua hàng hóa, dịch vụ của doanh nghiệp có thông báo không hoạt động tại địa chỉ của cơ quan thuế chưa đúng quy định; kê khai sai thuế GTGT là hàng hóa trứng gà (chưa qua sơ chế), chi phí lãi vay, khấu hao xuất chuyển cho chi nhánh Miền Bắc không tính thuế thành không chịu thuế.
Ngoài ra, Thực phẩm Hữu Nghị còn vi phạm một số quy định về thuế TNDN như chưa điều chỉnh chi phí không được trừ, khi xác định thu nhập chịu thuế TNDN đối với chi phí lãi vay vượt quá quy định; chưa điều chỉnh chi phí khoản xử phạt chậm nộp do vi phạm hành chính, khoản điều chỉnh chi phí không đúng quy định; chưa điều chỉnh chi phí trích trước không chi hết; hạch toán chi phí đối với các hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của doanh nghiệp có thông báo không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký của cơ quan thuế.
Công ty Thực phẩm Hữu Nghị bị phạt và truy thu hơn 1,1 tỷ đồng do các vi phạm về thuế.
Để khắc phục hậu quả của các vi phạm kể trên, Thực phẩm Hữu Nghị sẽ phải đóng khoản tiền phạt hơn 202 triệu đồng, đồng thời bị truy thu hơn 881 triệu đồng và đóng tiền chậm nộp thuế GTGT gần 25 triệu đồng. Tổng cộng, Thực phẩm Hữu Nghị sẽ phải nộp cho cơ quan thuế hơn 1,1 tỷ đồng.
Trước đó, đầu năm 2021, Cục Thuế TP Hà Nội cũng đã ban hành quyết định xử phạt vi phạm hành chính đối với Công ty Cổ phần Thực phẩm Hữu Nghị do có hành vi vi phạm pháp luật về thuế.
Theo đó, Công ty Cổ phần Thực phẩm Hữu Nghị bị phạt hành chính số tiền 165,8 triệu đồng. Bên cạnh đó, công ty buộc phải nộp đủ số tiền thuế thiếu, số tiền thuế trốn vào ngân sách Nhà nước 818,8 triệu đồng và tiền chậm nộp 82,6 triệu đồng.
Như vậy, tổng số tiền bị phạt, truy thu, chậm nộp Công ty Cổ phần Thực phẩm Hữu Nghị phải nộp vào ngân sách Nhà nước là 1,067 tỷ đồng.
Được biết, Công ty Cổ phần Thực phẩm Hữu Nghị (tiền thân là Nhà máy Bánh kẹo cao cấp Hữu Nghị) được thành lập năm 1997. Công ty hoạt động chính trong các lĩnh vực Sản xuất thức ăn chế biến sẵn; Chế biến, bảo quản thịt và sản phẩm từ thịt; Sản xuất rượu vang; Kinh doanh bất động sản. Địa bàn kinh doanh của Công ty trên toàn quốc và xuất khẩu sang một số nước Châu Á như Trung Quốc, Thái Lan, Campuchia, Hàn Quốc...