Theo kết quả kiểm toán năm 2021, Kiểm toán Nhà nước chỉ ra rằng tại Vinachem chưa xây dựng quy chế quản lý tiền, đinh mức tồn quỹ tiền mặt/tiền gửi ngân hàng, kế hoạch sử dụng dòng tiền (Công ty CP Phân lân nung chảy Văn Điển, Công ty CP Phân lân Ninh Bình, Công ty CP Phân bón và Hoá chất Cần Thơ). Công ty CP Phân lân nung chảy Văn Điển chưa xây dựng tiêu chí lựa chọn ngân hàng, chào lãi suất đến các tổ chức tín dụng khi gửi tiền.
Tập đoàn hoá chất Việt Nam. Ảnh: Nhật Huỳnh
Quản lý nợ chưa chặt chẽ, còn để phát sinh nợ phải thu quá hạn, khó đòi lớn tại Công ty mẹ là 10.493,30 tỷ đồng, Công ty CP Phân bón và Hoá chất Cần Thơ 54,65 tỷ đồng, Công ty CP Supe Phốt phát và Hoá chất Lâm Thao 31,69 tỷ đồng, Công ty CP DAP-Vinachem 26,21 tỷ đồng, Công ty CP Phân lân nung chảy Văn Điển 3,15 tỷ đồng, Công ty CP Phân lân Ninh Bình 2,59 tỷ đồng.
Mua sắm vật tư chưa phù hợp nhu cầu sử dụng dẫn đến tồn kho lâu ngày, chậm luân chuyển tại Công ty CP Supe Phốt phát và Hoá chất Lâm Thao 50,86 tỷ đồng, Công ty CP DAP-Vinachem 24,62 tỷ đồng. Có vốn chủ sở hữu lớn hơn vốn điều lệ được phê duyệt nhưng chưa được cơ quan có thẩm quyền xử lý theo quy định tại Công ty mẹ - Vinachem 697,52 tỷ đồng.
Trích Quỹ phát triển khoa học và Công nghệ của doanh nghiệp không đúng quy định hoặc chưa nộp vè Quỹ phát triển khoa học và công nghệ quốc gia số tiền đã trích nhưng sử dụng không hết Vinachem trích thử 1,52 tỷ đồng. Không có khả năng thanh toán các khoản nợ đến hạn, mất cân đối tài chính.
Một số khoản đầu tư của Vinachem vào công ty liên kết, đầu tư dài hạn khác bị thua lỗ, mất vốn. Công ty mẹ (02/09 công ty liên kết lỗ luỹ kế 123,69 tỷ đồng), Công ty CP Phân bón và Hoá chất Cần Thơ có 1 khoản đầu tư phải trích dự phòng 9,83 tỷ đồng.
Công ty CP Phân lân nung chảy Văn Điển có 2,28 ha đất chưa sử dụng hoặc không sử dụng hiệu quả. Về quản lý sử dụng đất Công ty TNHH MTV Apatit Việt Nam có 438,64 ha, Công ty CP Phân bón và Hoá chất Cần Thơ 0,42 ha chưa có đủ hồ sơ pháp lý.
Công ty TNHH MTV Apatit Việt Nam có 2,36 ha, Công ty CP Phân bón và Hoá chất Cần Thơ 0,42 ha chưa thực hiện đầy đủ nghĩa vụ với NSNN. Công ty TNHH MTV Apatit Việt Nam khai thác khoáng sản chưa có trong giấy phép khoảng 715.260 tấn, khai thác vượt trữ lượng được cấp phép 340.056 tấn.